The Cult - Peace Dog LIVE 04

En 1999, Astbury y Duffy reformaron The Cult con Matt Sorum y el ex-bajista de Porno for Pyros, Martyn LeNoble. Su primer concierto oficial fue en el Concierto de Libertad Tibetana en junio de 1999, después de haber ensayado en Los Ángeles. El tour de reunión de 1999 llamado 'Cult Rising' resultó en la venta de todos los boletos para 30 fechas en Estados Unidos, terminando con 8 noches consecutivas llenando el House of Ángeles.
En el 2000, la banda estuvo de tour en Sudáfrica y toda América y contribuyeron a la banda sonora de la película Gone In 60 Seconds con la canción “Painted on my Herat”. En junio, el esperado álbum de Ian Astbury fue finalmente lanzado con el título Spirit/ Light/ Speed, pero no logró mucho éxito. En noviembre del 2000, fue lanzada otra recopilación de grandes éxitos llamada Pure Cult: The Singles, junto con un DVD, que supero las 500’000 copias vendidas en Canadá.
En el 2001, la banda firmó un contrato con Atlantic Records y grabaron un álbum nuevo, Beyond Good and Evil, bajo la producción de Mick Jones de Foreigner, hasta que Jones se fue de tour con Foreigner. Astbury y Duffy co-escribieron una canción con Jones, algo inusual ya que en el pasado ni Astbury ni Duffy co-escribían su trabajo. Bob Rock fue el productor, Martyn LeNoble y Chris Wyse fueron los bajistas durante las grabaciones y Mike Dimkitch tocó la guitarra de acompañamiento durante el tour.
Sin embargo, Beyond Good And Evil no le dio a la banda el regreso que esperaban. A pesar de llegar al número #37 en E.U., #22 en Canadá y #25 en España, las ventas bajaron rápidamente, llegando apenas a las 500,000 copias vendidas en el mundo. El primer sencillo, "Rise", llegó al #41 en E.U. y al #2 en las tablas de rock, pero Atlantic Records pronto quitó la canción de las listas de radio. Ian Astbury describió la experiencia con Atlantic como una "destructora de almas", luego de que Atlantic trató de hacer cambios a las letras, la portada del álbum y la elección de los sencillos.